化肥大量使用使蔬菜瓜果品質(zhì)大大下降。由于作物不僅僅需要氮磷鉀，同時還需要鈣鐵鋅硒等許多微量元素，而化肥一般成分比較單一，所以長期使用化肥必然導(dǎo)致土壤中所含養(yǎng)分趨于單一，易使作物營養(yǎng)失調(diào)，從而導(dǎo)致作物內(nèi)部轉(zhuǎn)化合成受阻，必然導(dǎo)致作物品質(zhì)下降，瓜不甜，菜不香。 危害人體健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸鹽含量超標(biāo)，而亞硝酸鹽與胺類物質(zhì)結(jié)合形成N-亞硝酸基化合物為強(qiáng)致癌物質(zhì)。

生物菌肥料的優(yōu)點： 改良土壤 (1)通過有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物的根系周圍形成了優(yōu)勢種群，抑制了其他有害菌的生命活動。 (2)快速分解土壤有機(jī)物質(zhì)，促進(jìn)土壤團(tuán)粒的形成，且通過有益菌的活動能夠疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水、供水及透氣性都得到很好的調(diào)節(jié)。 (3)分解土壤中的農(nóng)藥殘留，避免殘留農(nóng)藥對下季作物產(chǎn)生藥害。還對植物生長過程通過根系排放的有害物質(zhì)進(jìn)行分解。

廄肥、堆肥、漚肥等，堆漚肥是以秸稈、雜草、樹葉、泥炭、垃圾以及農(nóng)村廢棄物為主要材料，加入適量的人畜糞尿而漚制成的有機(jī)肥，堆漚肥中的有機(jī)質(zhì)在厭氧前提下分解，養(yǎng)分不易揮發(fā)，且形成的養(yǎng)分多被土壤吸附，不易流失，肥效長而穩(wěn)，沼氣肥，在密封的沼氣池中，有機(jī)物腐解產(chǎn)生沼氣后的副產(chǎn)物，包括沼氣液和殘渣，是以畜禽糞便、動植物殘體、糊口垃圾等富含有機(jī)質(zhì)的固體廢棄物為主要原料，并添加一定量的其他輔料和發(fā)酵菌劑，通過工廠化方式加工出產(chǎn)而成的肥料。