化肥中不含有機質(zhì)、腐殖質(zhì)，因此大量使用化肥，土壤由于有機質(zhì)和腐殖質(zhì)的缺乏，土壤團粒結(jié)構(gòu)遭到破壞，造成土壤板結(jié)，農(nóng)植物產(chǎn)量下降。 化肥利用率低，氮肥因為易揮發(fā)、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因為磷酸根化學(xué)活性活潑，施入土壤后大部分磷與土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等陽離子結(jié)合形成難溶性磷肥。鉀的利用率也只有50%左右。

生物菌肥料的優(yōu)點： 固氮、解磷、解鉀功能 能夠部分利用空氣中的氮，通過有益菌生長代謝產(chǎn)生相應(yīng)的酶和酸，可對土壤中難溶性的磷、鉀肥(土壤中難溶性磷肥占95%，難溶性鉀占98%)進行分解，從而成為植物所能吸收的磷鉀肥。因此能夠大大提高作物對肥料的利用率，從而減少肥料的施用。 提高作物品質(zhì)。 解磷、解鉀的同時，能夠促使土壤中微量元素的釋放，被作物所利用，同時有益菌代謝產(chǎn)生多種植物所需的物質(zhì)，如小分子氨基酸、生長刺激物質(zhì)、維生素等。

有機肥還可以改良泥土，增加其保水保肥的能力，有機肥不光是我們在市場上購買的寫著有機肥字樣的產(chǎn)品，有機肥分為兩大類，一類為粗有機肥，一類為商品有機肥，有機肥就是沒有深加工的有機肥，它包括禽糞、畜糞、餅類、植物體等，再往下細分，禽糞包括鳥糞，雞糞等，畜糞包括豬糞，牛糞，羊糞等，餅類包括豆餅，油料，花生餅等，植物體又包括麥稈，稻殼等在農(nóng)村常見的東西，這些就是粗有機肥，只不外有些簡樸，使用需要進行再加工，例如鳥糞和禽糞需要高溫腐熟才能用。