生態有機肥具有完整的營養元素，可以改善土壤板結，改善化肥使用造成的土壤板結。改善土壤理化性質，增強土壤保水、保肥、供肥能力。 生物有機肥中的有益微生物進入土壤后，與土壤中的微生物形成共生增殖關系，抑制有害細菌的生長，轉化為有益細菌，相互作用，相互促進，起到群體協同作用。有益細菌在生長繁殖過程中產生大量代謝產物，促進有機物的分解和轉化，可以直接或間接為作物提供各種營養和刺激性物質，促進和控制作物的生長。

事實上，過量使用有機肥會造成與過量使用化肥相同的危害。表現為農作物根系吸水困難，容易出現燒根黃葉、幼苗僵硬、葉片變形等癥狀。嚴重的后果是農作物逐漸收縮干燥。過量應該怎么處理? 1.應加強通風，避免氣體損傷的擴散。有機肥料分解過程中產生的氨不會揮發。因此，在重蒸過程中，應增加放氣次數和放氣時間，以便及時將氨排出棚外，避免氣體損傷。 2、增加施肥量，覆根，用水沖洗。 盡量做基肥，深耕后施。改進施肥方法。 一是施用有機肥深施或覆蓋土壤，避免肥料撒在地面上，減少肥料流失、浪費和環境污染。

生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。