生態有機肥具有完整的營養元素，可以改善土壤板結，改善化肥使用造成的土壤板結。改善土壤理化性質，增強土壤保水、保肥、供肥能力。 生物有機肥中的有益微生物進入土壤后，與土壤中的微生物形成共生增殖關系，抑制有害細菌的生長，轉化為有益細菌，相互作用，相互促進，起到群體協同作用。有益細菌在生長繁殖過程中產生大量代謝產物，促進有機物的分解和轉化，可以直接或間接為作物提供各種營養和刺激性物質，促進和控制作物的生長。
有機肥料主要來源于植物和/或動物，應用于土壤中提供植物營養的含碳物質。它是由生物、動植物廢物和植物殘渣加工而成，富含有毒有害物質，包括許多有機酸、肽和豐富的營養元素，包括氮、磷和鉀。 當前耕地退化面積已占總耕地面積的40%以上。提高糧食產量的兩個關鍵因素是土壤肥力和土壤利用效率。
生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。
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