牛糞是一種非常好的有機肥，有不少農戶用其做肥料，效果相當不錯。它在施用時應注意以下幾點：(1)所用的牛糞必須經過腐熟，待其充分發酵分解后再使用，否則它在發酵時釋放的熱量有可能傷害植株，同時有可能將病菌引入土內。(2)提倡做基肥，進行溝施。牛糞的肥效釋放通常比較慢，同時它的鹽份含量一般比較高，所以宜做基肥施用，宜溝施并在施后覆土而不提倡撒施。如果用做面上撒施，則用量要控制，濃度一 定不能過高，以免出現肥害傷害植株。
牛糞必須經過發酵分解后才能用于農作物，否則牛糞中的某些病原微生物會灼傷農作物的根部。晾曬都可以，但曬干后，牛糞的部分營養會流失。牛糞經烘干機烘干，可達到烘干、除臭的目的。它還可以減輕手工勞動強度等。
牛糞自然發酵可采用以下方法: 1.晾干水分后，讓其自然堆積，堆積溫度達到60以上時保持24小時，然后上下翻轉，里里外外，繼續發酵。這個過程進行三次，達到發酵的目的。但是，這樣難聞的氣味不僅污染環境，還會造成營養物質的大量流失。 2.用微生物發酵法處理牛糞，不僅可以加快發酵進程，縮短發酵時間，防止浪費，提高牛糞的營養價值；而且牛糞可以在發酵溫度下干燥，節省能耗，成本低，操作簡單，易于推廣，因此受到用戶的歡迎。
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