在透射電鏡中，用電子束代替平行入射光束，用薄膜狀的樣品代替周期性結構物體，就可重復以上衍射成像過程，（2）對于透射電鏡，改變中間鏡的電流，使中間鏡的物平面從一次像平面移向物鏡的后焦面，可得到衍射譜，固定的目的主要是終止組織細胞的生化過程，同時把它們的超微結構改變控制在zui小范圍內，并保護這些結構在后續的脫水、包埋等過程中不被破壞；常用雙固定法，用一定濃度的戊二醛對樣品預固定，漂洗后使用鋨酸對樣品進行后固定。

鋨酸是強氧化劑，固定脂類、膜結構，有電子染色作用，3脫水，用適當的有機溶劑取代組織和細胞中的游離態水分，使之能與包埋劑混合，脫水要徹底，更換液體動作要迅速，脫水時間不宜過長，且固定后的樣品要充分漂洗，4滲透、包埋與聚合，4，1滲透，2包埋與聚合，加溫在60℃聚合形成固體基質，牢固地支撐整個細胞結構或組織，制成適于機械切割的固體樹脂包埋塊，利于切片，常用玻璃刀、鉆石刀進行超薄切片，刀上要裝水槽，并注入槽液。

染色方法有單染，包括鉛鹽單染和鈾鹽單染；雙染色，醋酸鈾染色和檸檬酸鉛染色，雙染色呈現結果更全面，我們一般采用的雙染法進行染色，常用染色劑：醋酸鈾，有微弱的放射性，主要染核酸、核蛋白、細胞核、結締組織，檸檬酸鉛，主要染膜結構、脂類、糖原等，易與CO2反應成沉淀，染色中應采取措施避免，電鏡照片主要解析粒徑分布、單晶/多晶、晶面結構、元素和原子分散，其本質是信號的空間分布，基本機理與比例尺地圖是一致的。