為了防止室外污染源進入潔凈區，使室內壓力高于潔凈區外的壓力，潔凈區內的壓力成為正壓潔凈區；相反，為了防止潔凈區內的污染源向實驗室外部擴散，使內部壓力低于外部壓力，這種實驗室就成為負壓潔凈區。所以潔凈室的正負壓力是相對的，主要取決于各個實驗室的相對壓力。PCR實驗室凈化有嚴格的壓力梯度，所以有嚴格的氣流方向。相鄰實驗區之間的壓力差為5Pa，實驗區與緩沖區之間的壓力差為5Pa。

潔凈實驗室是指對室內空氣環境參數如細菌濃度、塵埃數、溫度、濕度和壓力、潔凈度、溫度、濕度和氣流速度等的控制。通過人工控制和使用清潔技術。空氣潔凈度是指潔凈空氣環境中空氣的含塵量，空氣潔凈度的高低用粉塵濃度來劃分。潔凈度是指每升空氣中含有的粒徑≥0.5um的塵埃粒子的總顆粒數。中國的空氣潔凈度標準分為:100、1000、10000、100000。國際標準分為:一級、二級、三級、四級、五級。一般潔凈室分為兩級隔離，一級隔離通過生物安全柜、負壓隔離器、正壓防護服、手套、眼罩等實現。二級隔離通過實驗樓、空調凈化和電氣控制系統實現。

潔凈實驗室裝修常用材料選擇要求:實驗室的天花板采用防塵、光滑、阻燃的彩鋼板，兩面用槽鋁密封，彩鋼板用中性中國白玻璃膠密封。實驗室凈化區域專用PVC地板膠鋪地，防火等級Bl，耐酸、耐堿、耐腐蝕、耐磨性能符合國家標準實驗室要求；實驗室墻壁采用防塵、光滑、防火的彩鋼板，鋼板夾層。地槽采用50X30槽鋁，地槽用鋼釘和木塊固定。與地面和墻面、墻面和墻面、墻面和頂棚的過渡采用半徑為50mm的鋁合金圓弧處理；彩鋼板與彩鋼板之間用中性中國白玻璃膠密封，防止裂縫滋生細菌。