在運行過程中，始終監視反滲透主機的壓力、流量和水質指標。如有異常，要及時分析解決。需要化學清洗時，應及時清洗。 EDI精密電脫鹽裝置，注意產水水質、輕水和濃水進出口壓力、運行電壓和電流等技術參數，并根據技術參數的變化及時進行再生和化學清洗。

拋光樹脂過濾器。日常管理中注意進水水質。如果不符合設計要求，就不能進入，否則會太快失效。 堅持“每個處理單元出水水質不合格，不能進入下一個處理單元”的原則；否則會增加下一個單元的治療負荷，造成不可逆的損傷。

根據制藥行業的特殊性，制藥行業的純水設備由于采用低碳不銹鋼或其他經過驗證不會污染水質的材料制成，需要定期進行清洗、殺菌和消毒。而且整個設備從系統設計、材料選擇、制備工藝、儲存、配送、使用都需要按照水的標準來設置。