實驗室凈化主要檢測區域的壓力梯度和氣流方向為:試劑制備區、標本制備室、擴增區、產物分析區和測序室。壓力梯度不能混亂，氣流方向不能停滯或向后。同時，每個區域的緩沖室側與主測試區域之間的壓力差為+5Pa，以防止污染空氣從測試區域流向非污染區域。另外，PCR實驗室要充分通風，但同時也要考慮夏季和冬季的室內溫度過程要求和舒適度要求。

但是為了安全起見，凈化空調的風量需要很小，風量估計很大，一般都會超過規范。當要求不是很嚴格時，可以估計溫度和冷負荷。現在有專門的凈化空調機組，可以直接使用。二級生物安全實驗室應實行二級隔離。一般實驗室設備包括:潔凈工作臺、生物安全柜、邊桌或不銹鋼操作臺、洗滌臺等。潔凈實驗室裝修的建筑布局與凈化空調系統密切相關。凈化空調系統既要服從整體建筑布局，又要符合凈化空調系統的原理，以充分發揮相關功能。潔凈空調的設計者不僅要了解建筑布局來考慮系統布局，還要對建筑布局提出要求，使其符合潔凈實驗室的原則。

潔凈實驗室裝修常用材料選擇要求:實驗室的天花板采用防塵、光滑、阻燃的彩鋼板，兩面用槽鋁密封，彩鋼板用中性中國白玻璃膠密封。實驗室凈化區域專用PVC地板膠鋪地，防火等級Bl，耐酸、耐堿、耐腐蝕、耐磨性能符合國家標準實驗室要求；實驗室墻壁采用防塵、光滑、防火的彩鋼板，鋼板夾層。地槽采用50X30槽鋁，地槽用鋼釘和木塊固定。與地面和墻面、墻面和墻面、墻面和頂棚的過渡采用半徑為50mm的鋁合金圓弧處理；彩鋼板與彩鋼板之間用中性中國白玻璃膠密封，防止裂縫滋生細菌。