任務的計算方法和內容部分,“#”指以正常形式輸出計算結果,若希望以更為詳細的形式輸出結果,可寫作“#P”,若希望以精簡形式輸出,可寫作“#T”,“b3lyp”決定本次模擬采用DFT方法并選用b3lyp泛函進行計算,泛函應根據實際需要進行選擇,此處給出的較為通用且精度尚可的雜化泛函,例如Summary中包含了當前幀的基本信息(電子自旋、能量等),Optimization可顯示優化過程中體系的能量和平均受力(RMS)變化情況。
Multiwfn(http://sobereva,com/multiwfn/)則是sob老師開發的,功能極為強大的波函數分析軟件,該軟件可以極為方便的從計算輸出文件中提取出我們所關注的信息,極大簡化數據分析的難度,上述三個軟件的安裝在Windows系統還是Linux系統下均不困難,按照軟件安裝教程的步驟即可順利安裝,請注意在所有安裝路徑中不要出現中文,也建議不要出現空格(可用下劃線“_”代替空格)。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務的計算資源分配(核數、內存使用情況)、計算方法和精度、任務要求及計算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計算結果的結構模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計算過程中輸出信息,對于大多數含有過渡金屬的結構、自由基結構、激發態,如二茂鐵、基態氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進一步判斷。