任務(wù)的計(jì)算方法和內(nèi)容部分，“#”指以正常形式輸出計(jì)算結(jié)果，若希望以更為詳細(xì)的形式輸出結(jié)果，可寫(xiě)作“#P”，若希望以精簡(jiǎn)形式輸出，可寫(xiě)作“#T”，“b3lyp”決定本次模擬采用DFT方法并選用b3lyp泛函進(jìn)行計(jì)算，泛函應(yīng)根據(jù)實(shí)際需要進(jìn)行選擇，此處給出的較為通用且精度尚可的雜化泛函，例如Summary中包含了當(dāng)前幀的基本信息（電子自旋、能量等），Optimization可顯示優(yōu)化過(guò)程中體系的能量和平均受力（RMS）變化情況。

原子間的連接方式，這些字樣代表原子之間的連接關(guān)系，對(duì)于量化模擬毫無(wú)意義，故而可直接刪掉，這是由于量化模擬會(huì)在計(jì)算過(guò)程中根據(jù)原子各自電子云間的交疊情況自主判斷成鍵形式，因此軟件并不關(guān)心輸入模型中的化學(xué)鍵，換言之，在建模時(shí)，水分子中O和H之間畫(huà)成單鍵抑或三鍵，對(duì)于計(jì)算結(jié)果沒(méi)有任何影響，那么此時(shí)，Results欄中的“Vibrations”可選，從中可以分析分子的所有振動(dòng)形式及對(duì)應(yīng)的紅外光譜出峰位置，進(jìn)而生成該分子的理論紅外光譜。

輸入文件：文件后綴名通常為，gjf，包含模擬任務(wù)的計(jì)算資源分配（核數(shù)、內(nèi)存使用情況）、計(jì)算方法和精度、任務(wù)要求及計(jì)算模型等信息，輸出文件：文件后綴名通常為，out或，log，除輸出作為計(jì)算結(jié)果的結(jié)構(gòu)模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外，還包括了部分計(jì)算過(guò)程中輸出信息，對(duì)于大多數(shù)含有過(guò)渡金屬的結(jié)構(gòu)、自由基結(jié)構(gòu)、激發(fā)態(tài)，如二茂鐵、基態(tài)氧分子、羥基自由基等，均為開(kāi)殼層體系，自旋多重度大于1，需做進(jìn)一步判斷。