空格可用下劃線代替,例如“H2O_O2,gjf”,“Graphene_NH3,gjf”,接下來,我們以上圖為例介紹Gaussian輸入文件(,gjf)中所包含的信息,主要涉及到5部分內(nèi)容:,計(jì)算資源分配及輸出結(jié)果保存部分,倘若我們要對一個(gè)Fe3+進(jìn)行模擬,但并不知道自旋多重度應(yīng)取何值,且不擅長或無法通過軌道理論進(jìn)行判斷,那么可以通過計(jì)算Fe3+在不同自旋多重度下的單點(diǎn)能的方式來尋找其基態(tài)自旋多重度。
除上述軟件外,建議在本地電腦安裝一個(gè)專用的文本編輯器用于查閱和編輯輸入和輸出文件,推薦Notepad++,3,Gaussian軟件涉及的文件類型,Gaussian主要涉及的文件包括輸入文件、輸出文件、檢查點(diǎn)文件、讀寫文件等,初學(xué)者至少應(yīng)對前三者有一定了解,Gaussian的關(guān)鍵詞較多,除opt外用的較多的包括irc(反應(yīng)路徑)、freq(振動分析)、scan(勢能面掃描)、scrf(使用隱式溶劑)等。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務(wù)的計(jì)算資源分配(核數(shù)、內(nèi)存使用情況)、計(jì)算方法和精度、任務(wù)要求及計(jì)算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計(jì)算結(jié)果的結(jié)構(gòu)模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計(jì)算過程中輸出信息,對于大多數(shù)含有過渡金屬的結(jié)構(gòu)、自由基結(jié)構(gòu)、激發(fā)態(tài),如二茂鐵、基態(tài)氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進(jìn)一步判斷。