*補充說明：輸入文件，gjf內(nèi)容的zui末尾務(wù)必保證存在空行，否則在計算過程中會報錯，在Linux服務(wù)器中進行模擬，通過SSH遠(yuǎn)程連接服務(wù)器（圖中使用Xshell和Xftp軟件），Xftp用于在本地電腦和服務(wù)器間傳輸文件，在服務(wù)器端選擇合適的路徑建立文件夾并重命名為“H2O_opt”后進入該文件夾，將本地電腦端的H2O，隨后“ctrl+c”切出，并用“exit”命令即可關(guān)閉SSH遠(yuǎn)程連接而不導(dǎo)致計算任務(wù)中斷。

若該值設(shè)定不合理，則計算出來的結(jié)構(gòu)并非基態(tài)，這一部分內(nèi)容會在后文中詳細(xì)介紹，此處僅給出一個簡單的判斷標(biāo)準(zhǔn)，對于大多數(shù)不包含過渡金屬的基態(tài)分子，例如水、苯、SO42-、常規(guī)有機體系等均為閉殼層體系，其自旋多重度為1，模型，該體系中包含的1個O原子和2個H原子，以及這三個原子各自的笛卡爾坐標(biāo)，對比修改前后的輸入文件，可以看到我們刪除了第2行中“geom=connectivity”字樣和11-13行的內(nèi)容。

輸入文件：文件后綴名通常為，gjf，包含模擬任務(wù)的計算資源分配（核數(shù)、內(nèi)存使用情況）、計算方法和精度、任務(wù)要求及計算模型等信息，輸出文件：文件后綴名通常為，out或，log，除輸出作為計算結(jié)果的結(jié)構(gòu)模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外，還包括了部分計算過程中輸出信息，對于大多數(shù)含有過渡金屬的結(jié)構(gòu)、自由基結(jié)構(gòu)、激發(fā)態(tài)，如二茂鐵、基態(tài)氧分子、羥基自由基等，均為開殼層體系，自旋多重度大于1，需做進一步判斷。