動物恰當麻醉，腹部朝上綁定在操作臺上，開腹，透射電鏡有利于觀察灌注效果，不必觀察時，或某些需要保持腹腔器官原位置的實驗，可直接開胸，從劍突下小心剪破膈，使肺回縮（避免剪到肺造成出血），透射電鏡隨后向兩側擴大破口，與腹壁切口靠近，剪斷兩側肋骨，繼續向頭端擴展切口，直到露出心房，用吸管小心棄上清，加入預熱到40℃的GT2專用溶液重懸細胞（輕輕搖勻或吹吸均可，不要有肉眼可見的大塊）；立即以3000rpm離心10min。

小型實驗動物的腦深部組織、脊髓等不易快速取出固定的標本，或需要大范圍、多器官取材時，可采用經心臟灌注固定，透射電鏡固定液zui好采用2%多聚甲醛+2，5%戊二醛，需要保全心臟相關結構的實驗，或者要觀察肺組織充氣形態的實驗禁用經心臟灌注的方法，具體步驟如下：，這些數據的二次分析成為研究工作分析和論文撰寫的重要部分，尤其是高倍透射圖片，通過后處理可獲得很多充分的數據性結果，能夠為結構和機理等的深入分析提供有力證據。

生物樣品TEM各實驗步驟要求，取材和預固定，透射電鏡動物普通組織，一般動物組織的取材，要點一是減少缺血缺氧時間，二是減少機械損傷，麻醉或斷頸處死均可，可根據實驗目的和條件選擇，具體如下：請盡快用戊二醛固定液預固定，如圖5所示，對圖片做選取傅里葉變換，選擇第二種校正方法，出現的變換結果中，選種對應的變換對稱點，點擊ok，出現的對話框中，填入對應晶面的1/d數值，并將單位改為1/nm，點擊ok即可。