如果灌注成功，小心轉移動物尸體到潔凈托盤中，透射電鏡zui好用浸濕固定液的雙層紗布仔細覆蓋動物，再覆蓋一層保鮮膜，室溫等待1h，（等待1h的目的是使組織充分定型、硬化，減少手術切割時產生的機械損傷，不確定是否灌注成功時可不等待立即取材，4植物組織，植物組織取材需注意時間因素，用包埋樹脂或其混合液逐漸取代組織內的脫水劑，細胞內外所有的空隙被滲透填充，使包埋劑逐步滲透到組織細胞內部，以便與細胞外的包埋劑同時聚合。

動物恰當麻醉，腹部朝上綁定在操作臺上，開腹，透射電鏡有利于觀察灌注效果，不必觀察時，或某些需要保持腹腔器官原位置的實驗，可直接開胸，從劍突下小心剪破膈，使肺回縮（避免剪到肺造成出血），透射電鏡隨后向兩側擴大破口，與腹壁切口靠近，剪斷兩側肋骨，繼續向頭端擴展切口，直到露出心房，用吸管小心棄上清，加入預熱到40℃的GT2專用溶液重懸細胞（輕輕搖勻或吹吸均可，不要有肉眼可見的大塊）；立即以3000rpm離心10min。

生物樣品TEM各實驗步驟要求，取材和預固定，透射電鏡動物普通組織，一般動物組織的取材，要點一是減少缺血缺氧時間，二是減少機械損傷，麻醉或斷頸處死均可，可根據實驗目的和條件選擇，具體如下：請盡快用戊二醛固定液預固定，如圖5所示，對圖片做選取傅里葉變換，選擇第二種校正方法，出現的變換結果中，選種對應的變換對稱點，點擊ok，出現的對話框中，填入對應晶面的1/d數值，并將單位改為1/nm，點擊ok即可。